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Master Biotechnologies parcours Biochimie

Carte d'identité de la formation

  • 120 crédits ECTS
  • 4 semestres
  • Formation partiellement dispensée en anglais
  • La Rochelle

- de 1 mois pour accéder au 1er emploi
93% des diplômés sont en emploi
64% des diplômés ont obtenu leur 1er emploi suite à un stage
18 mois après l'obtention du diplôme

OBJECTIFS

Connaissances dispensées

Le master Biotechnologies parcours Biochimie forme des personnels d’encadrement amenés à travailler en laboratoires et entreprises biotechnologiques, agroalimentaires et chimiques. La formation propose des enseignements équilibrés en sciences et langages scientifiques pour l’ingénieur, en sciences et techniques du vivant et en techniques d’expression et de communication.
Le parcours Biochimie permet la maîtrise des aspects moléculaires du vivant, de la santé et des biotechnologies.
Un stage de 6 mois en master 2 est obligatoire pour l’obtention du diplôme tout comme un niveau minimal en anglais.

Compétences visées

Acquérir une solide culture générale en biochimie (maîtrise des caractéristiques des biomolécules, fonctionnements et dysfonctionnements cellulaires, valorisation)
Être capable d’assimiler et d’évoluer vers de nouvelles technologies
Connaître les mécanismes économiques et juridiques des entreprises
Percevoir la complexité sociale des entreprises et de leur organisation
Savoir aborder les questions relatives à la gestion individuelle et collective des ressources humaines
Maîtriser la communication écrite et orale
Communiquer dans deux langues étrangères

ADMISSION

Pré-requis

Des connaissances en biochimie, enzymologie, microbiologie, biologie moléculaire et chimie.

Modalités d'inscription

La sélection des candidats est réalisée sur dossier.
Les dossiers pour candidater en M1 sont à télécharger sur http://www.univ-larochelle.fr/Candidater-en-1ere-annee-de-master
Les dossiers pour candidater en M2 sont à télécharger sur http://www.univ-larochelle.fr/Candidater-en-2eme-annee-de-master

PROGRAMME

  • 24h (9h cours magistraux - 15h travaux dirigés)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24124C

  • Learning outcomes

    Acquiring sound knowledge of microorganism behaviour in the Environment and microorganism virulence.

  • Content

    Microorganism behaviour in the Environment in relation with life cycles and their use in an industrial environment : metabolites of interest production agents, physiological adaptations, metal vs. bacteria.
    Microorganism pathogenicity and antibiotherapy.
    Microorganisms and biofilms.
    Hospital-acquired infections.

  • Prerequisites

    Undergraduate level in Microbiology and Metabolic Biochemistry.

  • Language used for teaching

    English

  • 48h (30h lectures - 18h practical work)
  • 4 ECTS credits
  • Course code

    BIOC-24125C

  • 48h (21h cours magistraux - 18h travaux dirigés - 9h travaux pratiques)
  • 6 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    CHIM-24120C

  • 51h (30h cours magistraux - 21h travaux pratiques)
  • 6 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24121C

  • 24h (24h travaux dirigés)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    ANG-24131C

  • 42h (6h cours magistraux - 36h travaux dirigés)
  • 1 crédit ECTS
  • Code de l'EC

    GEST-24133C

  • 10h (6h cours magistraux - 4h travaux dirigés)
  • 1 crédit ECTS
  • Code de l'EC

    GEST-24132C

  • 30h (12h cours magistraux - 18h travaux dirigés)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    GEST-24134C

  • Learning outcomes

    This intensive course is directed towards advanced students and scientists who wish to expand or update their knowledge in the field of immunology and immunotherapy. The main goal of this course is to prepare students or scientists to work in immunology research labs (fundamental of applied immunology).

  • Content

    Most of the course is dedicated to the study and understanding of scientific papers dealing with immunology of viral, bacterial and inflammatory diseases. A focus is presented on recent cancer and HIV immunotherapeutic strategies.

  • Prerequisites

    This is not an introductory course ; attendees need to have a firm understanding of the basic principles of immunology and related techniques (see the undergraduate Year 3 course "Introductory Immunology course in Biochemistry").

  • Language used for teaching

    English

  • 33h (18h lectures - 15h tutorials)
  • 4 ECTS credits
  • Course code

    BIOC-24123C

  • 12h (12h cours magistraux)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24122C

  • 24h (15h cours magistraux - 9h travaux dirigés)
  • 3 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    CHIM-24223C

  • 39h (9h travaux dirigés - 30h travaux pratiques)
  • 1 crédit ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24222C

  • 21h (6h cours magistraux - 15h travaux dirigés)
  • 1 crédit ECTS
  • Code de l'EC

    GEST-24234C

  • 24h (24h travaux dirigés)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    ANG-24231C

  • 7h (7h cours magistraux)
  • 1 crédit ECTS
  • Code de l'EC

    DRPR-24233C

  • 8h (8h cours magistraux)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    ODP-24232C

  • 48h (30h cours magistraux - 18h travaux pratiques)
  • 4 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24220C

  • 12h (12h cours magistraux)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24221C

  • Objectifs

    Connaissances des familles virales et stratégies d’infection.

  • Contenu

    Virus à ADN, virus à ARN...

  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    STAGO-24207C

  • Objectifs

    Former les étudiants aux principales méthodes relevant de la discipline. L’accent est mis sur la pratique des méthodes, l’aide à l’interprétation et les applications bio-industrie et agroalimentaire.

  • Contenu

    1- Introduction
    2- Les données et les espaces
    Espace des individus, espace des variables
    3- Analyse en Composantes Principales (ACP)
    Solution, représentation des individus, représentation des variables, éléments supplémentaires,
    Métriques, exemple complet et applications en bio-industrie et agroalimentaire
    4- Analyse Factorielle des Correspondances Binaire (AFC)
    Double ACP, modèles pour tables de contingence, représentations graphiques, exemple complet et applications en bio-industrie et agroalimentaire
    5- Analyse de Hiérarchies et Partitions (AHP)
    Similarités et distances, structures en classification, classification hiérarchique ascendante, classification par partition, critères de validité, applications en bio-industrie et agroalimentaire

  • 54h (18h cours magistraux - 18h travaux dirigés - 18h travaux pratiques)
  • 4 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOTEC-24205C

  • Objectifs

    Former les étudiants à la méthodologie des plans d’expérience.

  • Contenu

    1- Approche de l’étude de la méthodologie des plans d’expériences (Plans Factoriels Complets mk, Plans Fractionnaires mk-p, Plans Composites Centraux et Plans de Mélange) :
    Stratégie d’étude, organisation des essais, minimisation du coût de l’étude, traitement des résultats, détection des effets significatifs et interactions entre les paramètres opératoires, surfaces de réponses, optimisation, etc.
    2- Application de cette méthodologie dans l’étude d’optimisation des opérations unitaires.

  • 24h (12h cours magistraux - 6h travaux dirigés - 6h travaux pratiques)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    MATA-24206C

  • 24h (18h cours magistraux - 6h travaux dirigés)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24225C

  • 17h (17h cours magistraux)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24226C

  • 15h (15h cours magistraux)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24224C

  • Objectifs

    Connaître l’organisation globale de la recherche en France et de son financement.

  • Contenu

    Organisation de la recherche en France
    Le financement de la recherche en France
    Séminaires de recherche sur des thématiques du laboratoire LIENSs UMR CNRS 6250
    Evaluation pratique du coût d’un stage de Master 2

  • 18h (12h cours magistraux - 6h travaux dirigés)
  • 3 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24308C

  • Objectifs

    Acquérir les notions permettant d’aller vers une chimie plus responsable au service de l’homme et de l’environnement. La chimie est à la recherche permanente de réactions et de transformations toujours plus performantes, plus efficaces en termes d’économie d’atomes, d’étapes et de sélectivité, lors de la synthèse totale de molécules d’origine naturelle complexes d’intérêt biologique. Elle se doit également d’etre plus respectueuse de l’environnement.. Le développement d’une chimie durable et plus responsable vis-à-vis de l’environnement doit supposer une alternative à l’utilisation de solvants organiques type COV.

  • Contenu

    Chimie éco-compatible ; Eco-conception : réactions multi-composants ; Réactifs « verts » : utilisation de matières premières renouvelables ; Utilisation du carbonate de diméthyle ; Synthèse et utilisation des liquides ioniques ; Synthèse organique dans l’eau ; Synthèse chimique assistée sous micro-onde ; Catalyse chimique et biocatalyse.

  • 18h (18h cours magistraux)
  • 3 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    CHIM-24305C

  • Learning outcomes

    Students will understand how each cell model responds to an environmental signal in time and space. The levels of reflection will be at three levels :
    - Molecular (cell signaling)
    - Functional (roles of enzymes and neo-synthesized molecules)
    - Physiological (interests for the cell of the mechanism involved)

  • Content

    -  Adaptative responses of prokaryotic and eukaryotic models to fluctuations of environmental parameters (e.g. molecular oxygen, redox potential , availability of carbon and nitrogen sources).
    -  Study of cellular signaling pathways
    -  Chemotaxis
    -  Cell-to-cell communication and quorum sensing

  • Language used for teaching

    English

  • 19h 30min (13h 30min lectures - 6h tutorials)
  • 3 ECTS credits
  • Course code

    BIOC-24302C

  • Objectifs

    Connaitre les notions de cryptome, et plus spécifiquement de cryptides, cibles ou agents thérapeutiques nouveaux, pouvant présenter une alternative aux drogues. Se sensibiliser à l’expérimentation in vivo, ses contraintes (réglementaires, éthiques, pratiques...) et aux solutions de remplacement...
    Présentation des grandes techniques d’analyse protéomique.

  • Contenu

    Peptides bioactifs... Cryptides
    Voies de génération
    Activités biologiques : de l’in vitro à l’in vivo
    Techniques d’analyse protéomique (nanopuces et nanooutils..)

  • 18h (12h cours magistraux - 6h travaux dirigés)
  • 3 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24301C

  • 21h (9h cours magistraux - 12h travaux dirigés)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    PROJ-24332C

  • 9h (3h cours magistraux - 6h travaux dirigés)
  • 1 crédit ECTS
  • Code de l'EC

    GEST-24334C

  • 15h (6h cours magistraux - 9h travaux dirigés)
  • 1 crédit ECTS
  • Code de l'EC

    ENV-24333C

  • Objectifs

    MODELISATION MOLECULAIRE
    -  Acquérir les notions de base de modélisation moléculaire (mécanique moléculaire vs mécanique quantique, les conformations des molécules, les coordonnées, les surfaces d’énergie potentielle, les mécanismes réactionnels, la simulation des spectres de vibration et d’absorption)
    -  La mécanique quantique : la méthode HF, les bases de fonctions, les méthodes DFT, les méthodes corrélées, les états électroniques excités, les effets de solvants
    -  La dynamique moléculaire, introduction du temps dans les simulations
    ANALYSE GLOBALE DU GENOME
    -  Acquérir les méthodologies et les outils informatiques d’analyse des génomes

  • Contenu

    MODELISATION MOLECULAIRE :
    -  Notions de modélisation moléculaire
    -  La mécanique quantique
    -  De la mécanique moléculaire à la dynamique
    ANALYSE GLOBALE DU GENOME :
    CM : Cartographies physique et génétique du génome, cartographie comparée. Recherche de gènes impliqués dans des maladies ou dans des caractères d’intérêt agronomique. Programmes de séquençage de génomes. Puces à ADN et étude du transcriptome.
    TD : Utilisation de logiciels d’analyse du génome, notamment sur Internet, pour la recherche de séquences dans des banques de données, la comparaison de séquences, la recherche de gènes potentiels, la recherche d’amorces pour la PCR ou le séquençage...

  • 18h (12h cours magistraux - 6h travaux dirigés)
  • 3 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24303C

  • Objectifs

    Familiariser les étudiants avec des concepts clés récents de Nanobiotechnologie
    Connaissance de structures biomimétiques
    Connaissance d’outils optiques de pointe et des technologies de type « puce »

  • Contenu

    -  Introduction des nanosciences et de la nanobiotechnologie
    -  Les nano-objets biologiques (Nanostructures protéo-lipidiques biomimétiques ; Nanoparticules minérales fonctionnalisées (applications médicales) ; Nanomachines du vivant)
    -  Exemple de méthode d’étude des nanobiotechnologies (Les outils optiques)
    -  Applications (Biocapteurs, Puces à ADN, Puces à Protéines ; Bio-puces à cellules, Laboratoires sur puces)

  • 12h (9h cours magistraux - 3h travaux dirigés)
  • 3 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24306C

  • 6h (6h travaux dirigés)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    GEST-24306C

  • Objectifs

    Nous visons ici la prise en compte des argumentaires économiques, sociaux, environnementaux et éthiques des partenaires de projets technologiques (partenaires scientifiques, industriels et institutionnels, associations, citoyens).
    Nous nous intéresserons à des projets technologiques interdisciplinaires liés aux biotechnologies qui sont au coeur des problématiques de la Fédération de recherche en environnement et développement durable.
    Les larges partenariats de recherche actuels nécessitent le travail commun de chercheurs appartenant à des disciplines qui n’ont que fort peu de points communs (par exemple les biotechnologies, le droit, l’éthique et la linguistique). C’est précisément à cette large interdisciplinarité que nous nous intéresserons dans le cadre de ce cours.

  • Contenu

    Des objectifs pédagogiques cognitifs pour une formation à l’interdisciplinarité : l’épistémologie, le débat et l’argumentation.
    Des objectifs pédagogiques transversaux pour une formation à l’interdisciplinarité : le travail collaboratif, l’ouverture sur d’autres champs disciplinaires
    Un enseignement interdisciplinaire utilisant les TICE, ouvert à des étudiants de formations différentes permet de :
    Décrire et construire une argumentation sous ses différents aspects :
    données scientifiques, objectifs,
    logique de l’argumentation,
    repérage des aspects rhétoriques,
    Participer à des débats interdisciplinaires de société liés au développement durable.

  • 18h (9h cours magistraux - 9h travaux dirigés)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    BIOC-24307C

  • 21h (21h cours magistraux)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    ODP-24305C

  • 24h (24h travaux dirigés)
  • 2 crédits ECTS
  • Code de l'EC

    ANG-24331C

ET APRÈS

Poursuite d'études

Doctorat

Métiers

Chercheur, ingénieur R&D
Responsable de production
Assureur qualité, certification, audit
Commercial
Responsable achats

Secteurs d'activité

  • Agro-alimentaire, agriculture
  • Biologie, biotechnologies
  • Santé, paramédical

Situation de l'emploi

Les titulaires du master Biotechnologie parcours Biochimie postulent avec succès à des offres d’emploi et de thèses. Le secteur est innovant et porteur.

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Faculté des Sciences et Technologies

avenue Michel Crépeau

17042 La Rochelle cedex 1

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Mis à jour le 9 mars 2017
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